“乌珠穆沁”，系蒙古语，为古代蒙古族部落的名称。其先民游牧于蒙古杭爱山脉盛产野山葡萄地带。
状元时期，成吉思汗15世孙达延汗统一漠南蒙古各部后，为了进一步巩固和加强漠南地区，将其长子图噜博罗特为首领的部族从漠北杭爱山一带调集到漠南，图噜博罗特的长子博第阿喇克的第三子翁衮都喇尔为乌珠穆沁部落首领。翁衮都喇尔之子多尔济车臣济农与察哈尔部不和，率部投奔了漠北喀尔喀车臣汗。1637年，乌珠穆沁部从漠北回归后归清。1761年，清政府在漠南推行盟旗制度，将乌珠穆沁、阿巴嘎、苏尼特、阿巴哈纳尔、浩齐特五部10旗，隶属锡林郭勒盟统辖。1949年将东乌珠穆旗和西乌珠穆沁旗旗编为东部联合旗。1956年撤销东部联合旗，恢复乌珠穆沁东西二旗名称，沿用至今。